ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ ШТАММОВ BACILLUS ANTHRACIS В КАЗАХСТАНЕ
Ключевые слова:
Bacillus anthracis, GenBank NCBI, штамм, ген, белки, делецияАннотация
Настоящая статья основана на сравнении результатов различных проверенных исследований и тенденций изменения молекулярно-генетических характеристик штаммов Bacillus anthracis за последние годы. В глобальной филогенетической структуре B. anthracis делится на три основные генетические группы: A, B и C. Распределение трех групп штаммов неравномерно: около 90% принадлежат к группе A, 10% к группе B и 0,1% к группе C. Из 35 белков в основной генетической группе A 8 являются вариабельными, остальные являются референтными штаммами, Spo0J - это единственный ген, но ген штамма Tsiankovskii-1 SNP 705T→C синонимичен этому гену. Spo0M - это ген с размерами 252 и 251 пн. Последний из генов отличается делецией T67, делецией генов 198-200. SpoIID - это два гена, референт и штамм 351/520 (canSNP-группа A.Br.Aust94) синонимичны этому гену SNP 927C→T. SpoVAD – негомологичный вариант 338 hpi во всех штаммах группы А. Консерватизм в группах штаммов B. anthracis характерен также для белков SpoIIE, белка споруляции фазы II P, SpoIIR, SpoIIIAA, SpoIIIAB, SpoIIIAE, SpoIIIAG, Spoiiid, SpoIVFA, SpoIVFB, SpoVAA, SpoVAE, SpoVID, Cdas, YlbJ, KinA. Напротив, KinB, вторая основная сенсорная гистидинкиназа, присутствует в трёх генах штаммов B. anthracis группы А.
Библиографические ссылки
Г.Г. Онищенко, И.В. Дармов, С.В. Борисевич. Сібір жарасы: Медициналық қорғаныс құралдарын әзірлеу мен енгізудің өзекті мәселелері/ 2-ші басылым, түзетілген және кеңейтілген. — Санкт-Петербург, 2018. — 592 б.[Sibirskaya yazva: aktual’nye problemy razrabotki i vnedreniya medicinskih sredstv zashchity / pod red. GG Onishchenko, IV Darmova, SV Borisevicha. 2-e izd., ispr. idop. Sankt-Peterburg; 2018. 592 s. (In Russ.)]
Rotz, L. D., Khan, A. S., Lillibridge, S. R., Ostroff, S. M., & Hughes, J. M. (2002). Public health assessment of potential biological terrorism agents. Emerging Infectious Diseases, 8(2), 225–230. https://doi.org/10.3201/eid0802.010164
Aikembayev, A. M., Lukhnova, L., Temiraliyeva, G., Meka-Mechenko, T., Pazylov, Y., Zakaryan, S., Denissov, G., Easterday, W. R., Van Ert, M. N., Keim, P., Francesconi, S. C., Blackburn, J. K., Hugh-Jones, M., & Hadfield, T. (2010). Historical distribution and molecular diversity of Bacillus anthracis, Kazakhstan. Emerging Infectious Diseases, 16(5), 789–796. https://doi.org/10.3201/eid1605.091427
Bruce, S. A., Schiraldi, N. J., Kamath, P. L., Easterday, W. R., & Turner, W. C. (2020). A classification framework for Bacillus anthracis defined by global genomic structure. Evolutionary Applications, 13(5), 935–944. https://doi.org/10.1111/eva.12911
Leendertz, F. H., Ellerbrok, H., Boesch, C., Couacy-Hymann, E., Mätz-Rensing, K., Hakenbeck, R., Bergmann, C., Abaza, P., Junglen, S., Moebius, Y., Vigilant, L., Formenty, P., & Pauli, G. (2004). Anthrax kills wild chimpanzees in a tropical rainforest. Nature, 430(6998), 451–452. https://doi.org/10.1038/nature02722
Klee, S. R., Brzuszkiewicz, E. B., Nattermann, H., Brüggemann, H., Dupke, S., Wollherr, A., Franz, T., Pauli, G., Appel, B., Liebl, W., Couacy-Hymann, E., Boesch, C., Meyer, F. D., Leendertz, F. H., Ellerbrok, H., Gottschalk, G., Grunow, R., & Liesegang, H. (2010). The genome of a Bacillus isolate causing anthrax in chimpanzees combines chromosomal properties of B. cereus with B. anthracis virulence plasmids. PLoS One, 5(7), e10986. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0010986
Van Ert, M. N., Easterday, W. R., Huynh, L. Y., Okinaka, R. T., Hugh-Jones, M. E., Ravel, J., Zanecki, S. R., Pearson, T., Simonson, T. S., U’Ren, J. M., Kachur, S. M., Leadem-Dougherty, R. R., Rhoton, S. D., Zinser, G., Farlow, J., Coker, P. R., Smith, K. L., Wang, B., Kenefic, L. J., … Keim, P. (2007). Global genetic population structure of Bacillus anthracis. PLoS One, 2(5), e461. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0000461
Eremenko, E. I., Pechkovskii, G. A., Pisarenko, S. V., Ryazanova, A. G., Kovalev, D. A., & others. (2021). Phylogenetics of Bacillus anthracis isolates from Russia and bordering countries. Infection, Genetics and Evolution, 92, 10489. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2021.104890
Еременко Е. И., Рязанова А. Г., Печковский Г. А., Писаренко С. В., Ковалев Д. А., Аксенова Л. Ю., Семенова О. В., & Куличенко А. Н. (2024). Bacillus anthracis-тің негізгі генетикалық желілерінің спора түзу ерекшеліктері. Өте қауіпті инфекциялар мәселелері, 2, 76–82. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2024-2-76-82[Eremenko, E. I., Ryazanova, A. G., Pechkovskiy, G. A., Pisarenko, S. V., Kovalev, D. A., Aksenova, L. Yu., Semenova, O. V., & Kulichenko, A. N. (2024). Spore formation features of main genetic lineages of Bacillus anthracis. Problems of Particularly Dangerous Infections, 2, 76–82. [in Russian]]
Першина, Е., Иванова, Е., Нагиева, А., Жиенгалиев, А., Чирак, Е., Андронов, Е., Сергалиев, Н. (2016). Сравнительный анализ микробиомов природных и антропогенно нарушенных почв северо-западного Казахстана. Почвоведение, 720–732.
https://doi.org/10.7868/S0032180X16060095
Goncharova, Y. O., Bogun, A. G., Bahtejeva, I. V., et al. (2022). Allelic polymorphism of anthrax pathogenicity factor genes as a means of estimating microbiological risks associated with climate change. Applied Biochemistry and Microbiology, 58(4), 382–393. https://doi.org/10.1134/S0003683822040056
И.С. Бейшова, Д.А. Гриценко, М.Х. Шамекова, А.С. Пожарский, Т.В. Ульянова, А.М. Ковальчук. Тұтас геномдық SNP талдауын қолдана отырып, үй жылқы тұқымдарының генетикалық әртүрлілігін зерттеу. Ізденістер, нәтижелер № (99)2023,ISSN 2304-3334. 48-50. https://doi.org/10.37884/3-2023/05
Tamura, K., Stecher, G., & Kumar, S. (2021). MEGA11: Molecular evolutionary genetics analysis version 11. Molecular Biology and Evolution, 38(7), 3022–3027. https://doi.org/10.1093/molbev/msab120
Olani, A., Galante, D., Lakew, M., Wakjira, B. S., Mekonnen, G. A., Rufael, T., Teklemariam, T., Kumilachew, W., Dejene, S., Woldemeskel, A., Wakjira, A., Abichu, G., Ashenafi, B., Kebede, N., Haile, A. F., Bari, F. D., Del Sambro, L., & Eguale, T. (2025). Identification of Bacillus anthracis strains from animal cases in Ethiopia and genetic characterization by whole-genome sequencing. Pathogens, 14(1), 39. https://doi.org/10.3390/pathogens14010039
Cieślik, P., Knap, J., Kołodziej, M., Mirski, T., Joniec, J., Graniak, G., Żakowska, D., Winnicka, I., & Bielawska-Dróżd, A. (2015). Real-time PCR identification of unique Bacillus anthracis sequences. Folia Biologica (Praha). https://doi.org/10.14712/fb2015061050178
Graniak, G., Olender, A., & Naylor, K. (2020). Differentiation of Bacillus anthracis and other Bacillus cereus group bacterial strains using multilocus sequence typing method. Acta Universitatis Lodziensis. Folia Biologica et Oecologica, 16(2). https://doi.org/10.18778/1730-2366.16.02
Anisimova, E. A., Fakhrutdinov, N. A., Mirgazov, D. A., Dodonova, E. A., Elizarova, I. A., Gorbunova, M. E., Khammadov, N. I., Zainullin, L. I., & Osyanin, K. A. (2022). Bacillus anthracis strain differentiation based on SNP and VNTR loci. Vavilov Journal of Genetics and Breeding, 26(6), 560–567. https://doi.org/10.18699/VJGB-22-68
Опубликован
Как цитировать
Выпуск
Раздел
Лицензия
Copyright (c) 2026 Izdenister natigeler

Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution-NonCommercial» («Атрибуция — Некоммерческое использование») 4.0 Всемирная.



