ИДЕНТИФИКАЦИЯ ВИРУСНЫХ ЗАБОЛЕВАНИИ ЯБЛОНИ В КАЗАХСТАНСКИХ САДАХ МЕТОДОМ ОТ-ПЦР-РВ
DOI:
https://doi.org/10.37884/3-2024/11Ключевые слова:
яблоня, подвои, сорт, вирусные заболевания, вироид, ACLSV, ASPV, AHVd, РНК, ОТ-ПЦР-РВ.Аннотация
В Казахстане яблоки занимают доминирующее место в агроэкономической нище страны, что доказывает огромные площади посевов этих культур. Однако уровень вирусной инфекции яблок, как правило, высок, поскольку широко используются подвои, полученные из зараженных вирусом материнских подвоев, а вегетативное размножение, основанное на прививке, широко распространено среди подвойных сортов. Наиболее эффективный способ борьбы с вирусами и вироидами растений зависит от проведения массово быстрого и точного диагностического обследования. Поэтому целью данного исследования было изучение распространения двух вирусов ACLSV, ASPV и вироида AHVd в трех областях Казахстана. Обнаружение вирусов основано на использовании сочетания методов обратной транскрипции и мультиплексной полимеразной цепной реакции с получением результата в режиме реального времени (ОТ-ПЦР-РВ). Среди 49 образцов, собранных из коммерческих садов южного и юго-восточного Казахстана, ОТ-ПЦР в реальном времени выявил положительные результаты 18,4% ACLSV, 10,2% AHVd, а так же 51,02% ASPV. Полученные результаты могут использоваться для оздоровления и получения безвирусного маточного материала. Таким образом решается проблема обеспечения рынка Казахстана качественным отечественным посадочным материалом яблони.
Библиографические ссылки
Galymbek K., A. K. Madenova, S. B. Bakirov, B. Zh Kabylbekova, A. Irkitbay, Zh Aitymbet, D. I. Kaldybayeva, R. Abdikarimova, and Bolat Munira. Monitoring the distribution and development of apple scab (Venturia inaequalis) and powdery mildew (Podosphaera leucotricha) disease in the southern and southeast regions of Kazakhstan //Bulletin of the Karaganda university Biology. Medicine. Geography series. – 2023. – Т. 110. – №. 2. – С. 38-45.
Shi W., Yao R., Sunwu R., Huang K., Liu Z., Li X., Yang Y., Wang J. Incidence and molecular identification of apple necrotic mosaic virus (ApNMV) in Southwest China //Plants. – 2020. – Т. 9. – №. 4. – С. 415.
EFSA Panel on Plant Health (EFSA PLH Panel), Bragard C., Dehnen-Schmutz K., Gonthier P., Jacques M., Jaques Miret J.A., Justesen A.F., MacLeod A., Magnusson C.S., Milonas P., et al. Pest categorisation of the Ralstonia solanacearum species complex //EFSA Journal. – 2019. – Т. 17. – №. 2. – С. e05618.
Wright A. A., Cross A. R., Harper S. J. A bushel of viruses: Identification of seventeen novel putative viruses by RNA-seq in six apple trees //PLoS One. – 2020. – Т. 15. – №. 1. – С. e0227669.
Saade M., Aparicio, F., Sanchez-Navarro, J. A., Herranz, M. C., Myrta, A., Di Terlizzi, B., Pallas, V. Simultaneous detection of the three ilarviruses affecting stone fruit trees by nonisotopic molecular hybridization and multiplex reverse-transcription polymerase chain reaction //Phytopathology. – 2000. – Т. 90. – №. 12. – С. 1330-1336.
Várallyay E., Přibylová J., Galbacs Z.N., Jahan A., Varga T., Špak J., Lenz O., Fránová J., Sedlák J., Koloniuk I. Detection of Apple hammerhead viroid, Apple Luteovirus 1 and Citrus Concave gum-associated virus in apple propagation materials and orchards in the Czech Republic and Hungary //Viruses. – 2022. – Т. 14. – №. 11. – С. 2347.
Hassan M., Polak J., Paprštein F. Detection and distribution of four pome fruit viruses in germplasm collection in the Czech Republic //XX International Symposium on Virus and Virus-Like Diseases of Temperate Fruit Crops-Fruit Tree Diseases 781. – 2006. – С. 113-118.
Yoshikawa N., Yaegashi H. Betaflexiviruses (Betaflexiviridae) //Encyclopedia of Virology. – 2021. – С. 229-238.
Zhang Z., Qi S., Tang N., Zhang X., Chen S., Zhu P., Wu Q. Discovery of replicating circular RNAs by RNA-seq and computational algorithms //PLoS pathogens. – 2014. – Т. 10. – №. 12. – С. E1004553.
Serra P., Messmer A., Sanderson D., James D., Flores R. Apple hammerhead viroid-like RNA is a bona fide viroid: Autonomous replication and structural features support its inclusion as a new member in the genus Pelamoviroid //Virus research. – 2018. – Т. 249. – С. 8-15.
Messmer A., Sanderson D., Braun G., Serra P., Flores R., James D. Molecular and phylogenetic identification of unique isolates of hammerhead viroid-like RNA from ‘Pacific Gala’apple (Malus domestica) in Canada //Canadian Journal of Plant Pathology. – 2017. – Т. 39. – №. 3. – С. 342-353.
Szostek S. A., Wright A. A., Harper S. J. First report of apple hammerhead viroid in the United States, Japan, Italy, Spain, and New Zealand //Plant Disease. – 2018. – Т. 102. – №. 12. – С. 2670-2670.
Hamdi I., Soltani R., Baraket G., Varsani A., Najar A. First report of apple hammerhead viroid infecting ‘Richared Delicious’ apple (Malus domestica) in Tunisia //Journal of Plant Pathology. – 2022. – Т. 104. – №. 2. – С. 811-812.
Chiumenti M., Navarro B., Venerito P., Civita F., Minafra A., Di Serio F. Molecular variability of apple hammerhead viroid from Italian apple varieties supports the relevance in vivo of its branched conformation stabilized by a kissing loop interaction //Virus research. – 2019. – Т. 270. – С. 197644.
Pareta N. F., Lateur M., Steyer S., Blouin A. G., Massart S. First reports of Apple luteovirus 1, Apple rubodvirus 1 and Apple hammerhead viroid infecting apples in Belgium //New Disease Reports. – 2022. – Т. 45. – №2.
Heo S., Chung Y. S. Rapid real-time detection method of ACLSV and ASSVd for apple quarantine field //Plant Biotechnology Reports. – 2021. – Т. 15. – С. 187-195.
Gritsenko D. A., Aubakirova K. P., Voitsekhovskiy I., Soldatova I., Galiakparov N. N. Simultaneous detection of five apple viruses by RT-PCR //International Journal of Biology and Chemistry. – 2020. – Т. 13. – №. 1. – С. 129-134.
Madenova A., Aitymbet Z., Bolat M., Kaldybayeva D., Galymbek K., Kuan A., Kabylbekova B., Irkitbay A., Yeszhanov T., Bakirov S., Sapakhova Z. Screening of Apple Cultivars for Scab Resistance in Kazakhstan //Horticulturae. – 2024. – Т. 10. – №. 2. – С. 184.
Загрузки
Опубликован
Как цитировать
Выпуск
Раздел
Лицензия
Copyright (c) 2024 Izdenister natigeler
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution-NonCommercial» («Атрибуция — Некоммерческое использование») 4.0 Всемирная.
