ТИПИЗАЦИЯ ВИРУСА ГРИППА ПТИЦ МЕТОДОМ ОТ-ПЦР
DOI:
https://doi.org/10.37884/4-2021/01Ключевые слова:
вирус, грипп птиц, Н5, типизация, гемагглютинин, подтипы гриппа, домашняя птица, ОТ-ПЦРАннотация
Вспышки птичьего гриппа среди диких и домашних птиц все больше являются частым явлением во всем мире. За последние 15 лет вспышки гриппа птиц, в частности вызванные вирусами H5, происходящими из линии A/Goose/Guangdong/1/1996, возникшей в Юго-Восточной Азии в 1996 г., все чаще происходили в Европе и Азии. В период с 2005 по 2020 год в мире было выявлено не менее десяти глобальных вспышек ВПГ H5, что привело к массовой гибели домашних и диких птиц. В последние годы применение молекулярных методов для обнаружения вирусных нуклеиновых кислот стало важным инструментом для выявления вируса гриппа птиц и идентификации подтипов гемагглютинина (HA) и нейраминидазы (NA). К числу таких методов относится ОТ-ПЦР. Обратная транскриптазная - полимеразная цепная реакция – реакция синтеза ДНК-копии (кДНК) на матрице РНК с использованием специального фермента – обратной транскриптазы, также называемой ревертазой. Затем кДНК амплифицируется с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР). В данной статье представлены результаты типирования вируса гриппа птиц методом ПЦР. В 2020 году в одном из частных подворий на территории Алматинской области был отмечен падеж домашней птицы, с симптомами похожими на вирус птичьего гриппа. В результате проведенных лабораторных исследований был типирован вирус гриппа птиц подтипа H5 методом ОТ-ПЦР.
Библиографические ссылки
Аналитический обзор ситуации на рынке птицеводческой продукции на 17 ноября 2020 года 2020 [Электронный ресурс] (http://ptica.kz/news/analiticheskij-obzor-situacii-na-rynke-pticevodcheskoj-produkcii-na-17-nojabrja-2020-goda).
Бияшев К.Б., Ермагамбетова С.Е., Сарыбаева Д.А., Жолдасбекова А.Е., Булегенова М.Д. Распространенность возбудителей кишечных инфекций у сельскохозяйственных птиц в различных регионах Казахстана. Ізденістер, нəтижелер – Исследование, результаты №3(87) ISSN 2304-3334 – С. 25.
Engelhardt, O.; Fodor, E. Functional association between viral and cellular transcription during influenza virus infection. Rev. Med. Virol. 2006, 16, 329–345, doi:10.1002/rmv.512.
Tong S, Zhu X, Li Y, Shi M, Zhang J, Bourgeois M, Yang H, Chen X, Recuenco S, Gomez J, et al New world bats harbor diverse influenza a viruses. PLoS Pathog. 2013;9(10):e1003657.
Medina, R.A.; Garcia‐Sastre, A. Influenza A viruses: New research developments. Nat. Rev. Microbiol. 2011, 9, 590–603, doi:10.1038/nrmicro2613.
de Graaf, M.; Fouchier, R.A. Role of receptor binding specificity in influenza A virus transmission and pathogenesis. EMBO J. 2014, 33, 823–841, doi:10.1002/embj.201387442.,]
Fouchier, R.A.M., Munster, V., Wallensten, A., Bestebroer, T.M., Herfst, S., Smith, D., Rimmelzwaan, G.F., Olsen, B. and Osterhaus, A.D.M.E., 2005. Characterization of a novel influenza a virus hemagglutinin subtype (H16) obtained from black-headed gulls. J Virol 79, 2814-22.
Stallknecht E.D. Ecology and epidemiology of avian influenza viruses in wild bird populations: waterfowl, shorebirds, pelicans, cormorants, etc., Proc. 4th International Symp. on Avian Influenza, May 29-31, 1997, Athens, USA, 61-67 р.
J. Cuthbert, T. Aarvak, E. Boros, T. Eskelin, V. Fedorenko, R. Karvonen et al. // Wildfowl. — 2018. — No. 68. — P. 44-69.
Вилков В.С. Перспективные ключевые орнитологические территории Северо-Казахстанской области / В.С. Вилков, И. А. Зубань // Проблемы управления речными бассейнами при освоении Сибири и Арктики в контексте глобального изменения климата планеты в XXI веке: c6. докл. XIX Междунар. науч.-практ. конф. — 2017. — С. 41–45.
Птичий грипп в Казахстане: причины, компенсации и меры по нераспространениюбря, 2020 [Электронный ресурс] strategy2050.kz: https://strategy2050.kz/ru/news/ptichiy-gripp-v-kazakhstane-prichiny-kompensatsii-i-mery-po-nerasprostraneniyu/
Xiao et al. BMC Veterinary Research (2019) 15:253 https://doi.org/10.1186/s12917-019-1985-7